RNAseq

Un análisis de RNAseq tiene el objetivo de cuantificar y comparar la expresión de genes a nivel de ARN mensajero (ARNm) en diferentes muestras o condiciones experimentales.

Este análisis permite identificar qué genes están siendo activados o desactivados, y en qué medida, en respuesta a diferentes factores, como condiciones ambientales, tratamientos, estados de enfermedad o diferencias entre especies.

A través de RNAseq, se puede obtener una visión integral del transcriptoma, que es el conjunto completo de transcripciones de ARN en una célula o tejido en un momento dado. Esto proporciona información valiosa sobre los procesos biológicos subyacentes, las vías moleculares involucradas y puede ayudar en la identificación de biomarcadores y una mejor comprensión de la biología celular y molecular.

Este servicio no incluye:

  • Extracción, purificación, preparación de librerías ni secuenciación de ARN
  • Discusión ni interpretación de los resultados obtenidos

Entregables:

  • Resultados de control de calidad de secuencias crudas y procesadas (html)
  • Secuencias del ensamble de transcriptoma (fasta)
  • Resultados de control de calidad del ensamble (BUSCO, Transrate) (pdf)
  • Archivo de anotación del ensamble usando la base de datos Uniprot y pfam (xls)
  • Gráfico de análisis multivariado (PCA; MDS) con los valores de expresión globales (eps/pdf)
  • Lista de genes/transcritos expresados diferencialmente (xls)
  • Gráficas de volcán, MA, heatmaps y patrones de expresión (eps/pdf)
  • Resultados de enriquecimiento funcional (Gene Ontology; KEGG)(xls)
  • Dashboard interactivo con genes expresados diferencialmente (html)